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| Registros recuperados : 30 | |
| 2. |  | COLETTA FILHO, H. D.; BORGES, K. M.; MACHADO, M. A. Ocorrencia de xylella fastidiosa em plantas candidatas a matrizes de laranja-doce, e transmissao por borbulhas contaminadas Laranja: Revista Tecnico-Cientifica de Citricultura, v.21, n.2, p.335-343, Cordeiropolis, SP, 2000| Biblioteca(s): Embrapa Mandioca e Fruticultura. |
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| 8. | | COLETTA FILHO, H. D.; RODRIGUES, C.; TAKITA, M. A.; MACHADO, M. A. Ensaio de patogenicidade da bactéria Xylella fastidiosa, estirpe J1 a 12, em plantas de tabaco. Fitopatologia Brasileira, Brasília, DF, v. 29, supl., p. S48, ago. 2004. Edição dos Resumos do XXXVII Congresso Brasileiro de Fitopatologia, Gramado, RS, ago. 2004.| Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
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| 10. | | CARVALHO, S. A. de; GIRARDI, E. A.; MOURÃO FILHO, F. de A.; FERRAREZI, R. S.; COLETTA FILHO, H. D. Advances in citrus propagation in Brazil. Revista Brasileira de Fruticultura, Jaboticabal, v. 41, n. 6, (e-422), 2019.| Biblioteca(s): Embrapa Mandioca e Fruticultura. |
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| 12. | | BOVANAES, L.; STUCHI, E. S.; SAFADY, N. G.; FRANCISCO, C. S.; GIL, M. C. S.; COLETTA-FILHO, H. D. Genetic structure of Candidatus Liberibacter asiaticus in brazil: the geographic regions and host effects. In: INTERNATIONAL CITRUS CONGRESS, 2016, Foz do Iguaçu. Sustainable citriculture: the role of applied knowledge: abstract book. Londrina: IAPAR; Campinas: IAC, 2016. Resumo S6-319, p. 88.| Biblioteca(s): Embrapa Mandioca e Fruticultura. |
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| 13. | | SOUZA, A. A. de; TAKITA, M. A.; PEREIRA, E. O.; RODRIGUES, C. M. COLETTA FILHO, H. D.; MACHADO, M. A. Expressão de genes de adesão e adaptação de Xylella fastidiosa durante crescimento in planta e formação de biofilme in vitro. Fitopatologia Brasileira, Brasília, DF, v. 29, supl., p. S44, ago. 2004. Edição dos Resumos do XXXVII Congresso Brasileiro de Fitopatologia, Gramado, RS, ago. 2004.| Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
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| 15. | | TARGON, M. L. P. N.; MACHADO, M. A.; COLETTA FILHO, H. D.; SOUZA, A. A.; MULLER, G. W. Sequencia de nucleotideos do gene da capa proteica de tres isolados brasileiros do virus da tristeza dos citros Summa Phytopathologica, v.26, n.2, p.201-205, Cordeiropolis, 2000| Biblioteca(s): Embrapa Mandioca e Fruticultura. |
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| 16. | | COLETTA-FILHO, H. D.; CARLOS, E. F.; TAKITA, M. A.; TARGON, M. L. P. N.; ALVES, K. C. S.; AMARAL, A. M. do; MACHADO, M. A. Effective detection and genome sequencing approaches of candidatus Liberibacter sp. causing Huanglongbing (HLB) in São Paulo, Brazil. In: INTERNATIONAL CITRUS CANKER AND HUANGLONGBING RESEARCH WORKSHOP, 2., 2005, Orlando. Proceedings... Orlando: Florida Citrus Mutual, 2005. p. 79| Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
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| 17. | | OSIRO, D.; COLNAGO, L. A.; OTOBONI, A. M. M. B.; LEMOS, E. G. M.; SOUZA, A. A.; COLETTA FILHO, H. D.; MACHADO, M. A. A kinetic model for Xylella fastidiosa adhesion, biofilm formation, and virulence. FEMS Microbiology Letters, v. 236, p. 313-318, 2004.| Biblioteca(s): Embrapa Instrumentação. |
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| 18. | | BASTIANEL, M.; DORNELLES, A. L. C.; MACHADO, M. A.; WICKERT, E.; MARASCHIN, S. de F.; COLETTA FILHO, H. D.; SCHÄFER, G. Caracterização de genótipos de Citrus spp. através de marcadores RAPD. Ciência Rural, Santa Maria, v. 31, n. 5, p. 763-768, set./out. 2001.| Biblioteca(s): Embrapa Mandioca e Fruticultura. |
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| 19. | | KUBO, K. S.; STUART, R. M.; FREITAS-ASTÚA, J.; ANTONIOLI-LUIZON, R.; LOCALI-FABRIS, E. C.; COLETTA-FILHO, H. D.; MACHADO, M. A.; KITAJIMA, E. W. Evaluation of the genetic variability of orchid fleck virus by single-strand conformational polymorphism analysis and nucleotide sequencing of a fragment from the nucleocapsid. Archives of Virology, v. 154, n. 6, p. 1009-1014, mai. 2009.| Biblioteca(s): Embrapa Mandioca e Fruticultura. |
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| 20. | | COLETTA-FILHO, H. D.; TARGON, M. L. P. N.; TAKITA, M. A.; DE NEGRI, J. D.; POMPEU JUNIOR, J.; MACHADO, M. A.; AMARAL, A. M.; MULLER, G. W. First report of the causal agent of Huanglongbing ("Candidatus Liberibacter asiaticus") in Brazil. Plant Disease, v. 88, n. 12, p. 1382, 2004.| Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
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| Registros recuperados : 30 | |
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 | Acesso ao texto completo restrito à biblioteca da Embrapa Mandioca e Fruticultura. Para informações adicionais entre em contato com cnpmf.biblioteca@embrapa.br. |
Registro Completo
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Biblioteca(s): |
Embrapa Mandioca e Fruticultura. |
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Data corrente: |
09/07/2009 |
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Data da última atualização: |
14/06/2023 |
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Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
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Circulação/Nível: |
A - 2 |
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Autoria: |
KUBO, K. S.; STUART, R. M.; FREITAS-ASTÚA, J.; ANTONIOLI-LUIZON, R.; LOCALI-FABRIS, E. C.; COLETTA-FILHO, H. D.; MACHADO, M. A.; KITAJIMA, E. W. |
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Afiliação: |
Karen Sumire Kubo, APTA; R. M. Stuart, APTA; Juliana Freitas-Ástua, CNPMF; Renata Antonioli-Luizon, APTA; Eliane Cristina Locali-Fabris, APTA; Helvecio Della Coletta-Filho, APTA; Marcos Antonio Machado, APTA; Elliot Watanabe Kitajima, ESALQ. |
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Título: |
Evaluation of the genetic variability of orchid fleck virus by single-strand conformational polymorphism analysis and nucleotide sequencing of a fragment from the nucleocapsid. |
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Ano de publicação: |
2009 |
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Fonte/Imprenta: |
Archives of Virology, v. 154, n. 6, p. 1009-1014, mai. 2009. |
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ISSN: |
0304-8608 |
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DOI: |
DOI 10.1007/s00705-009-0395-8 |
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Idioma: |
Inglês |
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Conteúdo: |
The variability of a fragment of the nucleocapsid gene of orchid fleck virus (OFV) was investigated by single-strand conformational polymorphism (SSCP) analysis and nucleotide sequencing. Forty-eight samples of 18 genera of orchids were collected from Brazil, Costa Rica and Australia. The SSCP analysis yielded six different band patterns, and phylogenetic analysis based on the nucleotide fragment sequence obtained in this work and six available in GenBank showed two different groups, one with isolates 023Germany and So-Japan, and other with the rest of the isolates. None of the analyses showed geographic correlation among the Brazilian strains. The data obtained in this study showed a low genetic variation in this region of the genome; the dN/dS ratio of 0.251-0.405 demonstrated a negative selective pressure that maintains the stability of the analyzed fragments. |
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Palavras-Chave: |
Nuclear type. |
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Thesaurus NAL: |
Orchid fleck virus. |
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Categoria do assunto: |
G Melhoramento Genético |
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Marc: |
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001 1654417
005 2023-06-14
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024 7 $aDOI 10.1007/s00705-009-0395-8$2DOI
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245 $aEvaluation of the genetic variability of orchid fleck virus by single-strand conformational polymorphism analysis and nucleotide sequencing of a fragment from the nucleocapsid.$h[electronic resource]
260 $c2009
520 $aThe variability of a fragment of the nucleocapsid gene of orchid fleck virus (OFV) was investigated by single-strand conformational polymorphism (SSCP) analysis and nucleotide sequencing. Forty-eight samples of 18 genera of orchids were collected from Brazil, Costa Rica and Australia. The SSCP analysis yielded six different band patterns, and phylogenetic analysis based on the nucleotide fragment sequence obtained in this work and six available in GenBank showed two different groups, one with isolates 023Germany and So-Japan, and other with the rest of the isolates. None of the analyses showed geographic correlation among the Brazilian strains. The data obtained in this study showed a low genetic variation in this region of the genome; the dN/dS ratio of 0.251-0.405 demonstrated a negative selective pressure that maintains the stability of the analyzed fragments.
650 $aOrchid fleck virus
653 $aNuclear type
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700 1 $aFREITAS-ASTÚA, J.
700 1 $aANTONIOLI-LUIZON, R.
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700 1 $aMACHADO, M. A.
700 1 $aKITAJIMA, E. W.
773 $tArchives of Virology$gv. 154, n. 6, p. 1009-1014, mai. 2009.
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Registro original: |
Embrapa Mandioca e Fruticultura (CNPMF) |
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